日本不仅不肯撤兵，而且其动议还蕴含着对中国宗主权的否定，中朝两国都无法接受，中日两军遂在朝鲜形成对峙，朝鲜半岛的局势由此重新变得复杂起来。

截至6月16日，日本陆军战时混成旅团第一部四千余人，已全部由仁川登陆，驻朝日军在兵力上大大超过华军，而且完全控制了汉城、仁川等重要城市，势头咄咄逼人。华军陷入进退两难的尴尬境地，为防不测，提督叶志超一面将军队集中在小城牙山待命，一面紧急向国内报告局势动态，请求指令。

中国zhengfu仍希望通过和平方式化解冲突，但仅仅一周后，日本外相陆奥宗光就向中国驻日公使汪凤藻提交了一份备忘录，上面对中方拒绝“共改朝政”深表遗憾，同时表示日本不会因为中国的拒绝而放弃这项动议，更不会撤退驻朝军队。这份外交照会后来被称为“第一次对华绝交书”。

既然已经对华绝交，日方当然不会再顾及中方的态度，日本继续向朝鲜大规模用兵。绝交书提交的次日，日军第五师团即开往朝鲜，事态由此变得愈加严重。

此前，面对朝鲜危局，紫禁城迅速出现了主战、主和两种声音。主战一方主要是帝党清流，帝党清流的幕后指挥者是翁同龢，他在控制着清流派的同时，主要通过文廷式来联络志锐等帝党成员，用以协调两派步骤。翁同龢本身是一个“尊王攘夷”者，一贯高调主战，翁同龢所辅佐的光绪皇帝年仅二十四岁，正当年轻气盛，亲政后颇思有所作为，对日作战的情绪也颇为高涨。

主和一方主要是后党。后党主和，一个重要原因是这一年恰逢慈禧的六旬大寿。在此之前，慈禧有两次生日都没能过好：第一次是她四十岁的时候，当年发生了日本侵台事件；第二次是五十岁的时候，发生了中法战争。慈禧对此耿耿于怀，她本人不希望到了六十大寿的时候，迎接她的又是战争，而不是隆重的庆典，所以倾向于通过外交手段消弭战端，保持和局，后党都是围绕着慈禧转的，其成员自然也持相似态度和政治立场。

兵部尚书孙毓汶直军机逾十年，且深得慈禧宠信，是后党的中坚分子。其时的军机处首席大臣、礼亲王世铎遇事模棱，从不主动提出任何建设性意见，孙毓汶因此成为枢府（军机处）真正的主心骨，枢府也因此为后党所控制。在和战议题上，孙毓汶与翁同龢相对立，另一位军机大臣、吏部左侍郎徐用仪紧随孙毓汶，更是一度和翁同龢吵到了脸红脖子粗的地步。

李鸿章与孙毓汶的私交很好，但和一些后党官员纯粹迎合慈禧不同，他与主战一方的实质性分歧，还是集中在仗到底能不能打，以及能不能打赢之上。

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